Repetitive Sequence-based Genomic Fingerprinting을 이용한 Vibrio 속 균의 분자분류 및 동정

Abstract

목적 : 여러 rep-PCR genomic fingerprinting 방법들을 실시하여 비브리오 균종간의 유전적 상관성을 조사하고 이를 이용한 V. vulnificus의 신속한 분자 동정법을 개발하고자 하였다.방법 : 이 연구에서 사용한 균주는 48주로서 REP-, ERIC-, BOX- 및 SERE-PCR을 13종의 비브리오를 대상으로 수행하였다.결과 : ERIC-PCR은 서로 구별이 가능하였으며 약 320bp 크기의 특이 절편이 V. vulnificus에서 발견되었다. 그러나 REP-, BOX- 및 SERE-PCR은 V. vulnificus 균주들을 다른 비브리오균종들로부터 분류하는데 효과적이지 못하였다.

Background : The aims of this study were to compare the suitability of repetitive-PCR genomic fingerprinting procedures to investigate genetic relatedness of the genus Vibrio and its applicability for the molecular identification of Vibrio vulnificus. Methods : Forty-eight Vibrio strains were included for this study. REP-, ERIC-, BOX- and SERE-PCR were compared with 13 members of the genus Vibrio. Results : REP-, BOX- and SERE-PCR showed V. vulnificus strains could not be separated well from other Vibrio species. However, approximately 320 bp of highly discriminatory specific fragments was recovered from V. vulnificus strains by ERIC-PCR. Conclusions : ERIC-PCR could be used as rapid classification and identification methods of V. vulnificus from other members of the genus Vibrio.(Korean J Med 71:189-197, 2006)