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유전자를 중간 매개로 고려한 동시발생 기반의 약물-질병 관계 추론Co-occurrence Based Drug-disease Relationship Inference with Genes as Mediators
- Other Titles
- Co-occurrence Based Drug-disease Relationship Inference with Genes as Mediators
- Issue Date
- 2018
- Publisher
- 한국정보기술학회
- Keywords
- text mining; data mining; co-occurrence; drug repositioning; bioinformatics
- Citation
- 한국정보기술학회논문지, v.16, no.11, pp.1 - 9
- Journal Title
- 한국정보기술학회논문지
- Volume
- 16
- Number
- 11
- Start Page
- 1
- End Page
- 9
- ISSN
- 1598-8619
- Abstract
- 신약 재창출은 현재 사용되는 약물의 새로운 용도를 발견하는 방법이다. 텍스트 마이닝은 정형화되지 않은 문서로부터 의미 있는 지식을 획득하는 과정을 의미한다. 본 논문에서는 약물-유전자와 유전자-질병에서 동시에 측정된 유전자 출현 빈도의 비율을 고려하여 새로운 약물-질병 관계를 추론하는 방법을 제안한다. 생물학적 문헌으로부터 약물-유전자와 유전자-질병의 동시출현 빈도를 측정하고 각 약물과 질병에 대하여 유전자의 출현 비율을 계산한다. 약물-질병 관계의 가중치는 동시에 측정된 유전자 출현 비율의 평균을 이용하여 계산되고 이를 이용하여 각 질병의 분류 정확도를 측정한다. 약물-질병 관계를 추론하는 것에서 동시출현 빈도를 문장 단위로 측정하고 여러 관계를 고려하는 방법이 기존 방법보다 더 정확히 식별해내는 것을 보였다.
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