미토콘드리아 DNA상의 유전자 다형성과 제2형 당뇨병과의 연관성 분석

Abstract

최근 많은 연구그룹들에 의해 제2형 당뇨병과 연관되어 있는 다양한 미토콘드리아 DNA의 SNP들이 보고 되었으나 보고된 SNP의 제2형 당뇨병과의 관련성은 분석집단이나 연구그룹에 따라 이견을 보이고 있다. 따라서 본 연구에서는 한국인에서의 미토콘드리아 DNA의 다형성과 제2형 당뇨병과의 연관관계를 분석하고 지금까지 보고되어있는 다른 민족 집단에서의 결과와 비교해보고자 하였다. 방법: 제2형 당뇨병환자군 147명과 정상인군 151명 총 298명의 말초혈액에서 DNA를 추출한 후 PCR 증폭을 통한 염기서열 분석을 실시하였다. 염기서열 분석은 DNASTAR program의 SeqMan software를 이용하였으며 발견된 SNP 는 NCBI 사이트와 V-mitoSNP site를 이용하여 기존에 보고된 SNP 결과와 비교하였다. 결과: 한국인 제2형 당뇨병에서미토콘드리아 DNA의 MT-RNR2와 MT-TL1, MT-ND1부위의 SNP 분석결과 한국인 제2형 당뇨병환자군에서는 정상인군으로부터 24개의 SNP를 발견하였다. 그러나 유럽이나 아시아에서 보고된 결과들과 다르게 한국인에서 발견된 mtDNA의 SNP는 제2형 당뇨병의 발병과 큰 연관이 없는 것으로 관찰되었다. 또한 각 SNP의 일배체형이나 개체당 SNP 발생률 비교를 통한 분석결과도 제2형 당뇨병환자군과 정상인군을 구별할 수 있는 점을 발견하기 어려웠다. 결론: 연구결과 발견된 24개의 SNP는 다른 민족들에서 의 결과와 다르게 한국인의 제2형 당뇨병과 큰 연관이 없는 것으로 관찰되었으며, 이러한 결과는 미토콘드리아 DNA의 SNP가 분석 대상이 되는 민족에 따라 제2형 당뇨병의 발병에 미치는 영향이 달라진다는 것을 암시한다.

Although many single nucleotide polymorphisms (SNPs) of mtDNA have been found to be associated with type 2 diabetes mellitus, the results of studies using different population samples and different methods are mixed. Therefore, we conducted a genetic association study of mtDNA SNPs and type 2 diabetes mellitus in a Korean sample and compared our results with those of studies conducted in other human populations. METHODS: A total of 298 blood samples from 147 type 2 diabetic patients and 151 normal controls were surveyed for SNPs via PCR directed sequencing. Sequencing analyses were performed using the SeqMan module of the DNASTAR program. The identified SNPs were compared to previously reported SNP lists on NCBI and V-mitoSNP. RESULTS: A total of 24 SNPs were identified in the MT-RNR2, MR-TL1 and MT-ND1 mtDNA genes in Korean type 2 diabetes mellitus patients and normal controls. The SNPs identified in the Korean sample were not closely associated with the type 2 diabetes mellitus phenotype, a significantly different result from those previously observed in European, Chinese and Japanese samples. Additionally, a haplotype and prevalence analysis could not detect any differences between the type 2 diabetes mellitus patients and normal controls. CONCLUSION: The 24 mtDNA SNPs were not associated with type 2 diabetes mellitus risk in our Korean sample. The results of the present study support the possibility that mtDNA SNPs have a differential effect on the risk of type 2 diabetes mellitus according to geographical origin.